Tim Cal Poly istražuje mikroorganizme stare od ~20.000 do 40.000.000 godina koji su pronađeni u jantaru i dubokim morskim jezgara. Cilj je otkriti male molekule sa antibiotskim svojstvima i identifikovati gene odgovorne za njihovu proizvodnju. Studentkinje Safiya Rufino i Kaitlyn Calligan fokusiraju se na sekundarne metabolite i proteinske strukture. Projekat je u ranoj fazi, ali može doprineti razumevanju otpornosti na antibiotike.
Drevne bakterije iz jantara: studenti Cal Poly tragaju za novim antibioticima — podseća na 'Jurassic Park'
Tim sa California Polytechnic State University predvođen profesorkom biohemije Katharine Watts i postdoktorkom Rachel Johnson proučava mikroorganizme zarobljene u jantaru i uzorke iz dubokih morskih jezgara koji su stari između oko 20.000 i 40.000.000 godina. Uzorke je obezbedio profesor emeritus Raul Cano, koji je ranije sarađivao sa naučnikom čiji je rad delimično inspirisao ideju iz romana 'Jurassic Park'.
Istraživanje se fokusira na pronalazak malih molekula sa potencijalnim antibiotskim svojstvima i na razumevanje genetskih mehanizama koji kodiraju njihovu sintezu. Uzorci se čuvaju na temperaturi od -80 °C, a tim analizira i same molekule i DNK kako bi identifikovao gene koji učestvuju u proizvodnji tih supstanci.
Studentkinje-istraživačice imaju jasno definisane uloge: Safiya Rufino se bavi sekundarnim metabolitima i traženjem prirodnih proizvoda koji mogu da inhibiraju rast savremenih bezopasnih patogena, dok Kaitlyn Calligan proučava proteinske strukture kako bi bolje razumela evoluciju i ekologiju ovih mikroba.
„Rad sa bakterijskim sojevima starim milioni godina je nadrealno“, rekla je Safiya Rufino. „Zamislim kako bi bilo da ožive u budućnosti i kako bi reagovale — ali naš cilj je nauka, ne senzacija.“
Iako rad podseća na filmske ideje o 'oživljavanju' drevnih organizama, istraživanje je usmereno na izolovanje i proučavanje malih molekula i gena, a sve laboratorijske procedure se sprovode na najnižem nivou biološke bezbednosti. Istraživači napominju da se radi pre svega o karakterisanju prirodnih proizvoda i, eventualno, o kloniranju pojedinačnih proteina radi studije njihove funkcije, a ne o rekonstrukciji ili kloniranju celih organizama.
Projekat je odgovor na globalni rast rezistencije na antibiotike: otkrivanje novih prirodnih antibiotika i razumevanje drevnih biosintetskih puteva može pomoći nauci da bolje razume kako se razvija otpornost i da otvori put ka novim terapijama. Trenutno je projekat u ranoj fazi istraživanja i nema neposrednih planova za razvoj lekova.
Obe studentkinje su korisnice programa BEACoN koji podržava nedovoljno zastupljene studente kroz istraživanje i mentorstvo, što im je omogućilo pristup laboratorijskim projektima i praktičnom iskustvu u oblasti biohemije i mikrobiologije.
Pomozite nam da budemo bolji.
